近日，第五附属医院微生态医学中心鄢秋龙团队在肠道微生态与粪菌移植精准转化研究中取得新进展。研究从“细菌—病毒跨界生态互作”的视角，为理解肠易激综合征患者粪菌移植疗效差异提供了新的证据，也为未来开展供体筛选、患者分层和个体化粪菌移植策略提供了候选标志物和研究框架。

肠易激综合征（IBS）是一种常见的慢性功能性胃肠疾病，患者可出现腹痛、腹胀、腹泻或便秘等症状，长期影响生活质量。粪菌移植（FMT）作为调节肠道微生态的重要手段，近年来在消化系统疾病干预中受到关注。然而，不同患者对粪菌移植的疗效反应存在明显差异，如何识别潜在获益人群、提高疗效预测能力，是推动微生态治疗精准化和规范化应用的重要科学问题。

围绕这一临床转化难题，研究团队基于发表的肠易激综合征粪菌移植队列数据，开展纵向、多界别宏基因组整合分析。研究共纳入83份样本，涵盖健康供体样本以及22例接受粪菌移植的肠易激综合征患者在移植前、移植后6个月和12个月的随访样本。团队综合运用微生物多样性分析、物种水平标志物筛选、细菌—病毒关联网络构建和探索性随机森林模型等方法，系统解析粪菌移植前后肠道细菌与病毒群落的动态变化。

研究发现，肠易激综合征患者与健康供体在肠道细菌和病毒群落结构方面存在明显差异。通过多界微生态分析，团队识别出223个细菌候选标志物和724个病毒候选标志物。其中，供体富集标志物主要包括与健康肠道生态相关的拟杆菌门成员，如 Bacteroides ovatus、Bacteroides faecis 等；而移植前患者富集标志物则更多来自具有潜在病理相关特征的厚壁菌门成员。

更为重要的是，研究显示，有疗效反应的患者在粪菌移植后能够在12个月随访期内维持更稳定的“供体样”肠道微生态状态，并形成更具韧性的细菌—病毒关联网络；相比之下，疗效不佳患者的微生态重塑稳定性不足，提示粪菌移植疗效可能不仅取决于单一细菌的变化，也与细菌、病毒等多界别微生物之间的生态协同密切相关。

研究团队还通过探索性机器学习模型筛选了与疗效反应相关的候选微生物特征，如 Ralstonia pickettii 等。团队同时谨慎指出，受样本量限制，模型经置换检验后尚未显示出超过随机水平的稳定预测效能，相关结果仍属于探索性发现，后续需要在更大规模、独立前瞻性队列中进一步验证。

作为南方医科大学第五附属医院微生态医学中心的重要研究成果之一，该论文体现了医院在肠道微生态、宏基因组学和转化医学交叉领域的持续探索。相关研究成果以“Cross-kingdom microbial associations characterize responsiveness to fecal microbiota transplantation in patients with irritable bowel syndrome”为题，在国际期刊 Journal of Translational Medicine 在线发表。第五附属医院微生态医学中心为第一署名单位，鄢秋龙为论文第一作者兼共同通讯作者。